超声清洗对大部分工件都是无损的。超声波清洗机尽管每秒上千次的微爆炸产生的效果是强劲的，但清洗过程是安全的，因为这种能量处在很小的能量量级上。但亦有例外的情况，有可能会引起被清洗工件的损伤。如何来避免清洗机损伤的发生，这里小型超声波清洗机就来介绍一下。千万不要选用有化学腐蚀的清洗液；不能把清洗的物体放到机器振动表面；有过高的超声波密度影响了；详细的看看下文的介绍。
1、被清洗物直接放置在超声振动体表面。会造成工件表面轻微划伤。应采用清洗吊篮等合理的清洗方式。工件于放置在有孔的托盘或网状托篮中。  
2、过强的超声功率密度。可能损害某些贵重精细物品的表面，如石英，猫眼石，珍珠，翡翠，孔雀石，绿宝石和珊瑚等。清洗此类物品时应慎重，可选用超声功率可连续调节的超声设备。   
3、选用了对被清洗物有化学腐蚀的清洗液。因为清洗剂对被洗工件的潜在的负作用有可能被超声波加强。应最小心的选择合适的超声清洗剂。